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GenBank数据库,什么是GenBank数据库？

数据库 2025-01-04 4

什么是GenBank数据库？

GenBank数据库，全称为美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）的核苷酸序列数据库，是世界上最大的公共核苷酸序列数据库之一。它由美国国立卫生研讨院（National Institutes of Health，NIH）部属的NCBI办理，是一个敞开获取的数据库，旨在搜集和供给全球范围内的生物分子序列数据。

GenBank数据库的前史与重要性

GenBank成立于1982年，自那时起，它一直是生物信息学范畴的重要资源。跟着基因组学和生物信息学的开展，GenBank的重要性日益凸显。它不仅为科研人员供给了很多的序列数据，并且促进了全球范围内的生物多样性研讨和生物技术开展。

GenBank数据库的内容

GenBank数据库包含了来自全球各地数百万条DNA和RNA序列数据，涵盖了多种生物体的基因组、转录组和蛋白质组数据。这些数据来历于测序工作者提交的序列、测序中心提交的很多EST序列和其它测序数据，以及与其它数据组织协作交流数据而来。

GenBank数据库的数据按以下类别进行分类：

基因组序列（Genome Sequences）

转录组序列（Transcript Sequences）

蛋白质组序列（Protein Sequences）

表达序列符号（Expressed Sequence Tags，ESTs）

序列符号位点（Sequence Tagged Sites，STSs）

基因组概览序列（Genome Survey Sequences，GSSs）

GenBank数据库的运用方法

经过NCBI的Entrez数据库查询体系进行查询。

运用BLAST程序对GenBank数据库进行不知道序列的同源性查找。

从NCBI的FTP服务器上下载完好的数据库或新数据。

GenBank数据库的优势

GenBank数据库具有以下优势：

数据量大：GenBank数据库包含了来自全球各地的数百万条序列数据，为科研人员供给了丰厚的数据资源。

数据更新快：GenBank数据库每天都会更新，文字供词了数据的时效性。

数据质量高：GenBank数据库对提交的数据进行严厉的审阅，文字供词了数据的质量。

数据同享：GenBank数据库是一个敞开获取的数据库，用户能够免费获取和运用数据。

GenBank数据库的使用

基因功用研讨：经过比较序列相似性，能够揣度不知道基因的功用。

基因组学研讨：GenBank数据库为基因组学研讨供给了重要的数据支撑。

生物信息学研讨：GenBank数据库是生物信息学研讨的重要数据来历。

药物研制：GenBank数据库为药物研制供给了重要的靶点信息。

GenBank数据库作为世界上最大的公共核苷酸序列数据库之一，为全球科研人员供给了丰厚的生物分子序列数据。它的敞开获取、数据量大、更新快、质量高级特色，使其成为生物科学范畴不可或缺的重要资源。


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