ppi数据库,探究蛋白质互作国际的钥匙

数据库 2025-02-26 2

PPI（ProteinProtein Interaction）数据库首要用于存储和供给蛋白质之间的相互作用信息，这关于了解蛋白质在细胞内的功用、调控网络以及生物学进程具有重要意义。以下是几个常用的PPI数据库及其特色：

1. STRING数据库：简介：STRING是一个综合性的蛋白质相互作用数据库，收录了超越5000个物种、2千多万种蛋白、30多亿个相互作用的信息。功用：STRING不只供给已知的蛋白质相互作用数据，还运用生物信息学办法猜测蛋白质之间的相互作用。它支撑多种功用剖析，如功用富集剖析（GO、KEGG）。。

2. BioGRID数据库：简介：BioGRID是一个生物医学互动库，经过全面的管理工作汇编数据，现在版别为4.4.242，收录了2,834,410个蛋白质和遗传相互作用。功用：BioGRID数据库供给了试验验证和猜测的蛋白质相互作用信息，支撑生物分子复合物结构和功用研讨。。

3. MINT数据库：简介：MINT（molecular interaction database）是一个由专家审阅过的蛋白质相互作用数据库，涵盖了607个物种，共117,001个蛋白质相互作用联系。功用：MINT数据库中的蛋白质相互作用都是由试验依据支撑的，供给了具体的互作信息。。

4. DIP数据库：简介：DIP（Database of Interacting Proteins）是一个搜集、收拾和存储蛋白质相互作用数据的数据库，支撑生物分子复合物结构和功用研讨。功用：DIP数据库供给了很多的试验验证的蛋白质相互作用数据，有助于研讨蛋白质在细胞内的功用。。

5. IntAct数据库：简介：IntAct是一个搜集和展现蛋白质相互作用的数据库，支撑生物分子复合物结构和功用研讨。功用：IntAct数据库供给了全面的蛋白质相互作用数据，支撑多种生物信息学剖析。。

这些数据库为生物学家供给了丰厚的蛋白质相互作用数据，协助研讨人员更好地了解蛋白质在细胞内的功用及其调控机制。假如您有特定的研讨需求，能够依据这些数据库的特色挑选合适的东西。

深化解析PPI数据库：探究蛋白质互作国际的钥匙

蛋白质-蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction，PPI）是生物体内最基本的生命活动之一，它触及蛋白质之间的相互作用，然后调控细胞内的信号传导、代谢途径和基因表达等进程。为了更好地了解和研讨PPI，科学家们开发了多种PPI数据库，这些数据库成为了探究蛋白质互作国际的钥匙。

STRING数据库：一个广泛运用的蛋白质相互作用数据库，供给了丰厚的蛋白质相互作用网络和功用注释信息。

BioGRID数据库：一个生物分子相互作用数据库，包含了很多的蛋白质-蛋白质相互作用数据。

GeneMANIA数据库：一个根据机器学习的PPI数据库，能够猜测蛋白质之间的相互作用和功用。

IntAct数据库：一个整合了多种生物分子相互作用的数据库，包含蛋白质、RNA和DNA等。

STRING数据库（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）是一个根据试验验证和核算猜测的蛋白质相互作用数据库。它供给了以下功用：

蛋白质相互作用网络：STRING数据库供给了一个交互式的蛋白质相互作用网络，用户能够可视化特定蛋白质或基因的相互作用联系。

信号传导通路：STRING数据库整合了多种信号通路的注释信息，用户能够查找特定通路中的蛋白质，并了解它们之间的相互作用和功用。

功用注释：STRING数据库供给了广泛的蛋白质功用注释信息，包含基因本体（Gene Ontology）注释、蛋白质域注释和拓扑域猜测等。

蛋白质功用猜测：经过剖析蛋白质之间的相互作用联系，能够猜测蛋白质的功用和生物学进程。

疾病研讨：PPI数据库能够协助研讨人员发现与疾病相关的蛋白质相互作用，然后为疾病的医治供给新的思路。

药物研制：PPI数据库能够用于发现药物靶点，然后加快药物研制进程。

体系生物学研讨：PPI数据库为体系生物学研讨供给了丰厚的数据资源，有助于了解细胞内杂乱的生物学进程。